故事的舞台，是還沒有人去過的地球上最後的秘境！哆啦A夢、大雄、靜香、胖虎與小夫他們因為覺得暑假無趣，因此打算去還沒被人入侵的地方進行一場刺激的大冒險。透過哆啦A夢的幫助，他們找到了「老煙槍叢林」。同時，大雄也撿到了一只小狗，名字叫做低頭（ペコ，音譯為貝可，又譯扁扁、白毛等）。
　　哆啦A夢等人受到胖虎的影響，決定不帶許多道具，憑一己之力與低頭一起找尋那神秘的寶藏。但是在途中卻遇到了許多奇特的事情，最後，連低頭也表明身分。他不是扁扁，他是保彎湖第一百零八世之子，因緣際會之下，認識了哆啦A夢等人。
　　原來，因為地形的影響，使內外的世界步向了不同的進化道路。而狗王國在距今五千年前，就有發達的科技！還發明了噴火車、飛天船。但是這些機械卻可能危害到外面世界的安全，因此，賢明的保彎湖一世便決定不再開發。
　　不料，當前掌權的達布蘭靼（ダブランダー），野心勃勃。命令科斯博士（コス博士）研究古代兵器，並殺死了國王、監禁忠於王子的衛士布魯斯（ブルスス）、活埋王子（即低頭）未遂，並強占王子深愛的絲比亞娜公主（スピアナ姫），在薩貝爾隊長（サベール）的忠心護主之下，自立為王，打算進攻人類世界！
　　王室一直流傳一則預言：「當王國遭竊之時，會有十名外國人，推動巨神像的心，拯救人民。」這十名外國人從何而來？而哆啦A夢等人，還有之後在狗王國碰到、家人被達布蘭靼強迫去做武器的奇波（チッポ）他們，是否能協助低頭王子，阻止達布蘭靼的陰謀，並順利奪回王位呢？